口服與注射型的小兒麻痹疫苗，兩者的保護效力是差不多的，但也各有其優(yōu)缺點，必須依照各個國家的防疫政策與經(jīng)濟狀況來選擇?？诜呙鐚倩钚詼p毒疫苗，優(yōu)點是方便、便宜，更因為它可以經(jīng)由糞便排出，使接觸者也同樣受到疫苗的作用，而兼具有群體免疫的效果：缺點則是接種前后半小時需要禁食，且因為是活性疫苗，有75萬～3百萬分之一的機率會引起小兒麻痹癥狀。
注射型疫苗的優(yōu)點是為非活性疫苗，所以沒有致病風(fēng)險，但價錢貴(是口服疫苗的幾十倍)則是其最大缺點，此外它也無法引起群體免疫。從前臺灣的小兒麻痹盛行率較高，因此政府全面采用口服疫苗以達成群體免疫：之后隨著多合一疫苗上市與國民經(jīng)濟力提升，自費選擇含注射型小兒麻痹疫苗的多合一疫苗比例漸增。
目前雖然其盛行率已低，但為求加強小兒麻痹的防疫，所以衛(wèi)生署仍建議選擇接種含注射型小兒麻痹疫苗之多合一疫苗(五合一、六合一)的寶寶，能配合后續(xù)疫苗接種的時程，再口服兩劑小兒麻痹疫苗，造福他人。此為國家防疫政策考量，并非疫苗優(yōu)劣的問題。
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