生殖器皰疹患者HSV原發(fā)感染中80鉑-90吭為隱性感染，初次感染恢復(fù)后大多數(shù)轉(zhuǎn)為潛伏感染，顯性感染只占少數(shù)，初次發(fā)病可分為原發(fā)感染與非原發(fā)感染。原發(fā)性生殖器皰疹潛伏期較短，一般為2-10天，平均5天。發(fā)病時及發(fā)病前期患者可有頭痛、肌肉酸痛、發(fā)熱、乏力等全身癥狀，有時伴排尿困難和白帶增多。患病部位先有燒灼感，出現(xiàn)一個或多個紅色小丘疹，伴有瘙癢，迅速變成小水皰，內(nèi)含淡黃色滲液，3-5天后多個成群水皰可形成膿皰，破潰后形成糜爛、潰瘍、結(jié)痂，伴有疼痛，最后結(jié)痂愈合。大多數(shù)男女病人雙側(cè)腹股溝淋巴結(jié)腫大、壓痛。一般全身癥狀可持續(xù)一周，整個發(fā)病過程約6周左右，痊愈后仍存在復(fù)發(fā)的可能。

感染HSV-2型感染者約60%可復(fù)發(fā)，感染HSV-1型者約15%復(fù)發(fā)，第一年可復(fù)發(fā)4-6次，以后復(fù)發(fā)次數(shù)逐漸減少。男性多發(fā)于龜頭、尿道口、陰囊等處，可并發(fā)淋巴管、淋巴結(jié)炎和精囊炎。女性多發(fā)于外陰、陰唇、肛周、子宮頸等處，陰道黏膜較少累及，偶爾并發(fā)陰道炎、宮頸炎，會出現(xiàn)白帶大量增多，陰道大量排液。后期炎癥波及尿道、膀胱時，可出現(xiàn)排尿困難、尿頻、尿痛、嚴(yán)重者可發(fā)生急性尿潴留，皰疹病毒還可以經(jīng)血行播散，引起腦炎、腦膜炎。部分患者在生殖器出現(xiàn)皰疹后的第2周左右伴有生殖器以外的病損，如臂部與手指。HSV直腸炎多見于有肛交行為的同性戀男性及異性戀女性患者，此外艾滋病患者可發(fā)生廣泛的肛門皰疹或直腸炎，表現(xiàn)為嚴(yán)重肛門、直腸疼痛、分泌物過多，發(fā)熱、里急后重等。新生兒生殖器皰疹，皮損看上去并不嚴(yán)重，僅1-2個水皰，部分患兒感染后沒有皮損，表現(xiàn)為神經(jīng)系統(tǒng)癥狀或敗血癥，死亡率很高。