生殖器皰疹常常會(huì)復(fù)發(fā)，第一次HSV-2型皰疹病毒感染后一年內(nèi)將近60%患者復(fù)發(fā)，大多在原發(fā)感染后1-4個(gè)月內(nèi)發(fā)生。第一年可復(fù)發(fā)4-6次，以后次數(shù)減少。HSV-l感染后只有14%復(fù)發(fā)，大大低于HSV-2感染的復(fù)發(fā)率。由于復(fù)發(fā)性生殖器皰疹反復(fù)發(fā)作又難以控制，有時(shí)疼痛較嚴(yán)重等原因，常使患者產(chǎn)生沉重的心理負(fù)擔(dān)，出現(xiàn)心理障礙，害怕致癌、害怕傳染給性伴侶、回避與性伴侶的性生活、不愿與異性交往、出現(xiàn)性功能障礙，影響家庭和睦，甚至發(fā)生抑郁癥。

生殖器皰疹病毒與生殖器惡性腫瘤關(guān)系密切。早在20世紀(jì)60年代就有人提出引起生殖器皰疹的HSV-2型皰疹病毒可能是宮頸癌的潛在致癌因子，并且發(fā)現(xiàn)生殖器皰疹常常與宮頸癌并發(fā)?；歼^生殖器皰疹的婦女比未患過者得宮頸癌的危險(xiǎn)性大5-10倍。最近，在宮頸癌組織、剝脫細(xì)胞或癌前期細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了HSV-2型皰疹病毒特異抗原，從而表明HSV-2型皰疹病毒在宮頸癌的發(fā)生過程中起了重要作用。另外，從陰莖癌患者的活檢材料中也觀察到單純皰疹病毒樣顆粒。

近年來人們也注意到孕婦與HSV-2型皰疹病毒感染的嚴(yán)重性。最重要的是傳染給新生兒。在妊娠早期，患生殖器皰疹的孕婦可影響胎兒，以致發(fā)生流產(chǎn)或死胎。嬰兒先天性感染，出生時(shí)可出現(xiàn)帶狀分布的皰疹，癲癇發(fā)作，肝脾腫大。如通過產(chǎn)道感染或羊膜早破而產(chǎn)生逆行感染時(shí)，輕者出生后數(shù)日乃至數(shù)周臨床上可無明顯癥狀。早期癥狀可僅有吃奶較差、興奮，隨后可發(fā)生病毒血癥或腦炎。嚴(yán)重者發(fā)生播散性生殖器皰疹病毒感染，可有高熱、呼吸困難、出血及中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變，預(yù)后不良。