HSV感染的潛伏期為2-10天，平均為6天。

HSV-1感染與HSV-2感染：原發(fā)性生殖器皰疹感染者為HSV-1型，經(jīng)過一定的靜止時期，繼而復(fù)發(fā)病變?yōu)镠SV-2型，形成周期性復(fù)發(fā)。每次發(fā)作的病程也較短，不用藥通常7天左右也可消退，繼而再犯。發(fā)熱、月經(jīng)、精神創(chuàng)傷、酗酒、食物及藥物都有可能導(dǎo)致加快復(fù)發(fā)的時間。HSV-1主要引起口唇皰疹，咽炎，角膜結(jié)膜炎和散發(fā)性腦炎，而HSV-2感染主要引起生殖器皰疹，但在臨床上也有相反情況。

HSV-1感染主要發(fā)生于口角、唇緣、鼻孔等皮膚粘膜交界處，亦可見顏面或口唇，開始局部先有灼癢及輕度緊張感，偶有伴發(fā)神經(jīng)痛。隨即出現(xiàn)紅斑，在紅斑基礎(chǔ)上發(fā)生簇集性小丘疹，迅速變?yōu)樗诹Ｖ辆G豆大小的水皰，內(nèi)容澄清，水皰破裂后出現(xiàn)糜爛面，數(shù)日后干燥結(jié)痂。自覺灼癢，偶有倦怠，不適和輕微發(fā)熱等全身癥狀，愈合可遺留暫時性色素沉著。全病程1-2周左右。

HSV-2感染主要發(fā)生于生殖器部位，患部先有燒灼感，很快在紅斑的基礎(chǔ)上發(fā)生成群的小水皰，多見男性包皮、龜頭、冠狀溝、陰莖等處，偶見于尿道;女性常見于陰唇、陰蒂、陰道、宮頸等處.水皰可逐漸變成膿皰，約6天左右破潰而形成糜爛或淺的潰瘍，自覺疼痛。病人可發(fā)生尿道炎，出現(xiàn)排尿困難。多數(shù)人有腹股溝淋巴結(jié)腫大疼痛，有的病人可出現(xiàn)發(fā)熱、肌肉痛及腦膜炎癥狀。如發(fā)于女性宮頸者可形成潰瘍壞死，陰道分泌物增多，可有下腹痛應(yīng)注意有無宮頸癌發(fā)生。孕期患生殖器皰疹時易致流產(chǎn)、早產(chǎn)或死胎，并易使新生兒感染，發(fā)生新生兒單純皰疹。該病一般經(jīng)過3周左右可以痊愈，但常有反復(fù)發(fā)作，一般原發(fā)疹后2～5個月內(nèi)復(fù)發(fā)，癥狀較原發(fā)者輕，范圍亦小，局限于生殖器部位，有時僅有1～2個皰疹，病程亦短，自發(fā)病至愈合6～10天。該病也可伴有生殖器以外部位的感染，如口唇、臂部及中樞神經(jīng)系統(tǒng)等。