一般情況下，三個月寶寶有痰可能是上呼吸道感染、小兒支氣管炎、肺炎等原因導致的。可通過日常調(diào)理、藥物治療等方式改善此癥狀，具體分析如下：

1.上呼吸道感染：寶寶咳嗽時有痰，可能是上呼吸道感染所致，癥狀輕者一般無需特殊治療。家長可以在醫(yī)生指導下給寶寶拍背，促進排痰，另外可適當喂溫水。

2.小兒支氣管炎：若是有痰，伴隨發(fā)熱、氣促、咳嗽等現(xiàn)象。可能是小兒支氣管炎所致。家長應注意室內(nèi)通風換氣，讓寶寶多喝水，定時拍背，促進痰液的排出。家長可遵醫(yī)囑給寶寶服用頭孢克肟片、對乙酰氨基酚片等藥物進行治療。

3.肺炎：寶寶由于年齡較小，抵抗力較低，容易患肺炎，所以當咳嗽有痰時伴有嘔吐、痰堵、痰憋等情況，家長應及時帶寶寶就醫(yī)，尋求專業(yè)醫(yī)生的幫助。

除以上相對常見的原因外，還可能是喉軟骨軟化導致的。建議先去醫(yī)院就診，完善相關檢查，明確病因，進行對因治療。