初次感染生殖器皰疹的患者中，80%～90%為隱性感染，即沒有臨床癥狀。顯性感染只是少數(shù)，一般初次感染恢復(fù)后多數(shù)轉(zhuǎn)為潛伏感染。

(1)原發(fā)性生殖器皰疹：潛伏期2～7天。患者有頭痛，肌痛，發(fā)熱、無(wú)力等全身癥狀。原發(fā)損害是1個(gè)或多個(gè)瘙癢的紅色丘疹，迅速變成水皰，3～5天后皰疹破潰形成糜爛、潰瘍，伴有疼痛。皮損單發(fā)或愈合，男性好發(fā)于龜頭、冠狀溝、陰莖體或尿道口，女性多發(fā)于陰唇、肛周或陰道，約90%同時(shí)侵犯子宮頸，也可累及直腸黏膜。一般全身癥狀可持續(xù)5～7天，整個(gè)發(fā)病過程約6周。痊愈后仍存在復(fù)發(fā)的機(jī)會(huì)。

(2)復(fù)發(fā)性生殖器皰疹：多在原發(fā)感染后1～4個(gè)月內(nèi)復(fù)發(fā)，復(fù)發(fā)率約為60%。疲勞、消化不良、月經(jīng)來潮、氣候變化、情緒波動(dòng)等都能成為誘發(fā)因素。復(fù)發(fā)時(shí)多仍在原發(fā)部位，臨床表現(xiàn)與原發(fā)性的相似，但癥狀輕，皮疹范圍小，病程也短，一般在數(shù)日內(nèi)可自愈。復(fù)發(fā)前1～2天，局部常有刺癢或燒灼感等前驅(qū)癥狀。臨床上所見到的復(fù)發(fā)性生殖器皰疹患者絕大部分為男性，女性患者由于癥狀不明顯常不來就診。發(fā)病后病程較短，一般平均8天能痊愈。

(3)直腸肛門皰疹病毒感染：發(fā)生在男性同性戀者?；颊吒亻T直腸疼痛，肛門有分泌物，大便時(shí)有里急后重感。

(4)新生兒感染：孕婦發(fā)生原發(fā)性生殖器皰疹常可導(dǎo)致流產(chǎn)、早產(chǎn)、胎兒異常甚或死胎。50%新生兒感染是發(fā)生在經(jīng)原發(fā)感染孕婦產(chǎn)道分娩時(shí)，可出現(xiàn)高熱、皰疹、肝脾結(jié)腫大、腦炎、敗血癥，可致死亡。孕婦復(fù)發(fā)感染時(shí)，新生兒感染的機(jī)會(huì)為5%。